中国为最早发现、最早命名、最早开发经营南海诸岛的国家，中国人民在南海地区长期的开发经营活动中，留下了大量的历史文献资料。近年来，我院从中国大陆及台湾各图书馆或档案管理机构等单位收集了大量涉南海史料，内容丰富、史料详实。

其主要包括：地图、政府公文、往来电讯稿、会议纪要、摄影照片、战后我接收西南沙群岛的进驻文献记载等，绝大多数为民国时期官方档案。鉴于上述档案文献的稀缺而宝贵，我院于2014年初特设“南海档案及历史文献库”对部分史料文献进行陈列和展示，旨在搜集我南海维权历史法理证据，启发国人认识中国在南海的领土主权和海洋权益，增强国民海洋意识。