中国南海研究院位于中国海南省海口市美兰区江东新区，是以南海为专门研究对象并从事相关学术研究与交流的专业学术研究机构,其前身为 “海南南海研究中心”，创立于1996年。2004年7月，升格更名为“中国南海研究院”。 2013年1月，“中国南海研究院北京分院”正式成立。2018年10月，获批设立博士后科研工作站。2019年7月，获社会科学研究系列中法学、历史学等一级学科专业的职称自主评审权。

经过近三十年的探索和发展，现有5个内设研究机构和2个管理机构，分别为海洋法律与政策研究所、南海历史文化研究所、区域国别研究所、海上丝绸之路与海洋安全研究所、公共外交与海南开放研究所，以及综合管理办公室、国际交流与学术合作部。目前拥有专兼职研究人员50余人，研究领域涵盖南海史地、海洋法、国际关系、海洋经济、资源开发、海洋治理、蓝色碳汇、公共外交等。

中国南海研究院发挥国家级特色专业智库的功能和作用，致力于建设中国南海问题研究基地、海洋治理人才培养基地和涉南海问题国际交流平台，为维护中国南海领土主权和海洋权益、和平解决南海争端、推动区域海洋治理与合作提供智力支持。中国南海研究院与东盟、美国、日本、韩国、加拿大以及中国台湾地区搭建了一系列的机制化学术交流平台，形成了一批智库“二轨”交流精品项目，形成了集国际会议渠道、主流媒体资源和学术人脉关系于一体的智库合作网络。